18.01.2011e.
· Sposoby dojrzewania prekursorowego RNA
o Modyfikacja końców
o Wycinanie intronów
o Cięcie
o Modyfikacja chemiczna
· Dojrzewanie zwiększa możliwości kodującego genomu bez konieczności zwiększania liczby kopii
· Modyfikacje końców łańcucha RNA dotyczą pre mRNA i spliciongu
· Krótko po rozpoczęciu elongacji dosyntetyzowana jest czapeczka
· Odgrywa ina pewną rolę w transpoecie mRNA i snRNA przez importynę
· Jej główna rola dotyczy translacji
· Terminacja u eukariote zachldzi dopiero w odległości 1000-2000n od rzeczywistego końca 3’ –OH
· Poliadenylacja, łańcuch poli A może sięgać długości 250n nukleotydów
· Składanie (splicing) pre mRNa występuje u eukariota i archeobakterii
· Samo wycinanie intronów pre mRNA
o Wiązanie fosfoestrowe jest przenoszone do doG-OH, pęka pierwsze wiązanie eksonu-intron
o Fosfoestrowe wiązanie z eksonu 2 przenoszone jest do końca eksonu 1 łącząc dwa eksony
· Rybozymy
o Samowycycinającie się inteony grupy1, 2, 3
o Rybonukleaza P, wytwarza końce bakteryjnego 5’RNA. Skałada się z aktywnej podjednostki RNA i części białkowej
o RNA rybosomów ma aktywność transferazy peptydylowej potrzebnej do wytworzenia
· Wycinanie intronów GU-AG
o Biorą w nim udział snRNA tworząc kompeksy z białkami (U1, U2, U3, U4, U5, U6)
o U1 poprzez komplementację RNA RNA rozpoznaje miejsce cięcia 5’
o Drugi koniec stanowi U2, U4, razem z U6 oraz U5
o Cięcie po stronie 5’ intronu poprzez transestryfikację
· Wtcinanie intronów pretRNA
o endonukleaza
· wycinanie końców tRNA u E. coli
· etapy powsatawnia mRNA
o przyłączenie czapeczki
o cięcie końca transkryptu, 3’
o dodanie końcówki poli A
o wycinanie intronów
o składanie eksonów
· redagowanie mRNA ludzkiej apolipoproteiny B
· 1/3 genów u człowieka podlega alternatywnemu składania
· Introny są na ogół większe niż eksony
· Modyfikacje chemiczne nukleotydów tRNA i rRNa
o Metylacja
o Deaminacja
o Podstawianie siarki
o Izomeryzacja zasad, urydyna do pseudourydyny
o Przemiana wiązania podwójnego w pojedyncze
o Zmiana nukleotydów (keozyna)
· Czas trwania mRNA
o Prokariota – kilka minut
o Eukariota – kilka godzin
· Degradację mRNA przeprowadzają nukleazy
· U eukariota rozpoczyna się ona deadenylacją i odcięciem czapeczki
· Część genów która ulega translacji na bviałko nazywa się otwartą ramką
Translacja
· Wysoka precyzja
· Czteropoziomowa struktura białek
o Pierwszorzędowa
o Drugorzędowa
o Trzeciorzędowa
o Czwartorzędowa
· tRNA
o ramię antykodonowe – zawiera 3 nukleotydy łączące się z mRNA
o ramie D – nazwa pochodzi od zmodyfikowanej dihydrourydyny
o pętla zmienna – zawiera 3-5 nukleotydów tRNa kalsy I, 13-22 tRNA kalsy 2
o
· Kod genetyczny
o Trójkowy
o Zdegenerowany (tylko tryptofan i metionina kodowane są przez jeden kodon)
o Cechy kodu genetycznego
§ Trójkowy
§ Uniwersalny
§ Niezachodzący
§ Bez przecinków
§ Zdegenerowany
· Jedna cząsteczka tRNA może odczytywać do trzech kodonów
· Bakterie odczytują swoje mRNA przy pomocy 30 różnych tRNA
· Mitochondria człowieka mają tylko
· Odstępstwa od zasady uniwersalnoścu kodu genetycznego
· Zachodzący kod genetyczny – zachodzi u wirusów
· Zasada tolerancji Cricka – możliwe jest tworzenie nietypowych par zasad między trzecią zasadą kodonu i pierwszą antykodonu
· Powstanie kodu genetycznego
o Powstał w wersji obecnej i zachowany bezziennie
· Proces inicjacji u prokariota
· Elongajca
· Suoressa
· Inteiny
· Potranslacyjne modyfikacje chemiczne
o Acetylacja
o Fosforylacja
o Glikozylacja
· Ubikwityny – wyznaczają białka przeznaczone do degradacji sam proces przebiega w pro
· Tempo translacji – ilośc błędów jednen aminokwas na 20 białek
· Choroby i inne dysfunkcje powodowane przez mutację, złe zwiniecie białka
·
paulinka88x