AMINOKWASY.pdf
(
311 KB
)
Pobierz
<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01//EN" "http://www.w3.org/TR/html4/strict.dtd">
AMINOKWASY
zwiĢzki dwufunkcyjne;
H
O
w naturze > 500, kodowane – ok. 20 ŗ
a-
aminokwas
R
C
C
100 000 róŇnych białek
OH
NH
2
AMINOKWASY
SYNTETYCZNE
(NIENATURALNE)
NIEBIAŁKOWE
NATURALNE
kilkaset
TRZECIORZĦDOWE
modyfikacje
postrybosomalne z
niepeptydowymi
wiĢzaniami
kowalencyjnymi
BIAŁKOWE
(kilkadziesiĢt)
PIERWSZORZĦDOWE
(kodowane, 20 lub 21)
substraty w syntezie
rybosomalnej
DRUGORZĦDOWE
wynik postrybosomalnej
modyfikacji
EGZOGENNE
ENDOGENNE
Inne podziały:
·
-….aminokwasy)
NH
2
-CHR-(CH
2
)
x
-COOH x = 0,1,2…; r
z
ħ
dowo
Ļę
gr. aminowej;
Ze wzgl
ħ
du na
pozycj
ħ
grupy aminowej (
a
-,
b
-,
g
·
glikogenne
(przetwarzane w glukoz
ħ
lub glikogen w przypadku niedoboru
w
ħ
glowodanów: Gly, Ala, Ser, Thr, Val, Asp, Glu, Arg, His, Met, Pro),
ketogenne
(keton
ko
ı
cowym produktem przemiany np. Leu)
·
Alifatyczne, aromatyczne, heterocykliczne…
·
Oboj
ħ
tne, kwasowe, zasadowe
AMINOKWASY KODOWANE:
- niepolarne, hydrofobowe, np.:
Leu
,
Ile,
Pro,
Val
, Ala,
Trp
,
Phe
,
Met
…
- polarne, nienaładowane, np.: Gly, Ser, Asn, Cys,
Thr
, Tyr…
- kwaĻne, np.: Asp, Glu;
- zasadowe, np.:
Arg
,
Lys
,
His
.
1
20 Aaa kodowanych,
8 Aaa
niezb
ħ
dnych
(nie syntezowanych przez dojrzałego człowieka)
21 Aaa –
selenocysteina (
Sec
)
NH
2
-CH-COOH
1986 r.
CH
2
-Se
rekodowanie kodonu terminalnego UGA; Sec bardziej nukleofilowa vs Cys ŗ enzymy
|
22 Aaa – L-pyrrolysine – pirolizyna?
B. Hao, W. Gong, T.K.Ferguson, C.M. James, J.A. Krzycki, M.K. Chan,
A new UAG-encoded residue in the
structure of a mathanogen methyltransferase,
Science 2002,
296
, 1462
X
O
NH
2
OH
H
O
N
X = OH, NH
2
,CH
3
“
Stop codon” UAG enzymatycznie reprogramowany do syntezy “pyrrolysine”. Nieoczekiwana
róŇnorodnoĻę ¼ nowe enzymy o znaczeniu przemysłowym.?
Hydroliza białek ŗ 24 Aaa (dawniej - 22 Aaa) (kodowane + Cys-Cys + Hyp)
[O]
2R
SH
R
-S-S-
R
[H]
Nomenklatura i symbolika:
-
nazwa zwiĢzana z: pierwszĢ izolacjĢ [Ņródłem - Asp (łac. –
asparagus
), Cys (gr. –
cystis
–
pħcherz], sposobem wyodrħbniania (Arg – w post. soli Ag, Trp – prod. degr. trypsynĢ),
podobieıstwem do innych zwiĢzków (Val – od kw. walerianowego)
-
z wyjĢtkiem Trp, przyrostek
–ina lub –yna
-
reszty
(H
2
N-CHR-CO-) przyrostek
–ylo
[glutamylo- (Glu-), aspartylo-, glutaminylo- (Gln-),
asparaginylo-]
-
skróty
trzyliterowe
, konfiguracja wħgla
a
zawarta w symbolu (L-alanina = Ala, A –
jednoliterowy
skrót biochemiczny)
COOH
COOH
H
2
N
H
HO
H
R
CH
2
OH
aldehyd L-glicerynowy
(
S
)-2,3-dihydroksypropanal
L-aminokwas
-
allo
-L-izoleucyna –
aIle
,
hydroksy
lizyna –
Hy
l
,
allo
-L-
hydroksy
prolina -
aHy
p
-
nor
walina –
N
va
2
-
grupa aminowa – A (kw.
a
-aminomasłowy – Abu,
a
-aminoadypinowy Aad)
dwie grupy aminowe – D (
a
,
g
-diaminomasłowy – Dbu)
połoŇenia w pozycjach
a
i
w
nie sĢ uwzglħdniane w nazwie, inne tak (
b
-Ala)
N
-metylowalina – MeVal
WŁA
ĺ
CIWO
ĺ
CI CHEMICZNE
Aminokwasy sĢ zwiĢzkami amfoterycznymi, tworzĢ sole obojnacze.
OH
OH
NH
3
-CHR-COOH
NH
2
-CHR-COO
NH
3
-CHR-COO
H
H
K
a,
1
NH
3
-CH
2
-COOH
NH
3
-CH
2
-COO
pK
a,1
= 2.4 (wplyw NH
3
)
K
a,2
pK
a,2
= 9.8 (NH
3
, a nie COOH)
NH
2
-CH
2
-COO
NH
3
-CH
2
-COO
pK
a,1
+
pK
a,2
= pI
punkt izoelektryczny
2
max. stħŇenie jonu obojnaczego (minimalny
ładunek)
Gly -
pI
= ½ (2.4 + 9.8) = 6.1
pK
1
1.9
pK
2
pK
3
NH
3
-CH-COO
NH
2
-CH-COO
NH
3
-CH-COOH
NH
3
-CH-COO
3.7
9.6
CH
2
COO
CH
2
COOH
CH
2
COOH
CH
2
COO
pI
= ½ (1.9 + 3.7) = 2.8 (Asp)
pK
2
pK
3
pK
1
2.2
H
3
N-CH-COO
NH
2
-CH-COO
NH
2
-CH-COO
NH
3
-CH-COOH
9.0
10.5
(CH
2
)
4
NH
3
(CH
2
)
4
NH
3
(CH
2
)
4
NH
2
(CH
2
)
4
NH
3
pI
= ½ (9.0 + 10.5) = 9.7 (Lys)
3
ń
RÓDŁA AMINOKWASÓW
1. Hydrolizaty białkowe
2. Metody mikrobiologiczne
3. Metody enzymatyczne
·
rozdział racemicznych pochodnych Aaa
·
synteza asymetryczna
4. Metody syntetyczne
®
produkty achiralne/produkty chiralne
SYNTEZA
1.
Bromowanie i aminowanie kwasów karboksylowych
Br
2
NH
3,
H
2
O
CH
3
CH
2
COOH
CH
3
CHCOOH
CH
3
CHCOOH
PBr
3
Br
NH
2
80%
(
R,S)
-Ala, 56%
Małe zastosowanie, zwykle niskie wydajnoĻci.
2.
Synteza Gabriela
(z ftalimidku potasu)
Alkilowanie anionu ftalimidowego (1,2-benzenodikarboksylowego). Czynnik alkilujĢcy – produkt
bromowania malonianu dietylowego.
4
1. EtO Na, EtOH
2. RX
O
O
O
COOC
2
H
5
COOC
2
H
5
COOC
2
H
5
N K
HC
Br
+
N
CH
CR
N
COOC
2
H
5
COOC
2
H
5
COOC
2
H
5
O
O
O
ester imidomalonowy
H, T
COOH
O
O
COOH
COOH
COOH
-CO
2
NH
3
-CHR-COO
CHR
N
N
CR
COOH
O
O
3.
Synteza Strecker’a
Działanie amoniakiem i cyjanowodorem na aldehydy.
OH
NH
2
O
R
-H
2
O
HC
N
NH
3
R
C
CN
R
C
NH
2
C
NH
R
C
H
H
H
H
aminonitryl
H, H
2
O, T
R-HC-COOH
NH
2
4.
Redukcyjne aminowanie
a
-oksokwasów
(laboratoryjny analog biosyntezy)
O
NH
3
C
H
3
C
COOH
H
3
C
C
COOH
NaBH
4
a
-
NH
2
kwas
oksopropanowy
(pirogronowy)
R,S-
Ala
5. Synteza amidomalonianowa
Najbardziej uniwersalna.
COOEt
COOEt
COOEt
COOEt
COOEt
COOEt
H
3
O
H
3
O
EtON
a
EtONa
R-X
S
N
2
R-X
S
N
2
C
C
COOEt
COOEt
R
R
C
C
COOEt
COOEt
H
H
C
C
COOEt
COOEt
NH-CO-CH
3
NH-CO-CH
3
NH-CO-CH
3
NH-CO-CH
3
NH-CO-CH
3
NH-CO-CH
3
H
3
O
H
3
O
+ CO
2
+ 2EtOH + CH
3
COOH
+ CO
2
+ 2EtOH + CH
3
COOH
R-CH-COOH
NH
2
5
Plik z chomika:
Alazet
Inne pliki z tego folderu:
A New Method for the Synthesis of Ephedrine.pdf
(159 KB)
A.A. Shulgin - PiHKAL [ENG].pdf
(2472 KB)
AMINOKWASY.pdf
(311 KB)
AMINY.pdf
(366 KB)
Chemikalia oznaczenia.pdf
(166 KB)
Inne foldery tego chomika:
_sciagane lamanie Wi-Fi
► ► Czytelnia
► Ojczyzna
►Dokumenty-Akty Prawne,Przepisy,Wzory Umów
✦✦ Gazety
Zgłoś jeśli
naruszono regulamin